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新型コロナは同じ株でも再感染する?2026年の変異株・免疫・検査を徹底解説

篠原 淳平 篠原 淳平 • 更新: • 公開: • 読了約 28 分
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新型コロナウイルス感染症は、一度感染して回復すれば、同じ変異株にはもう感染しないのでしょうか。答えは「いいえ」です。前回と同じ変異株であっても、再感染する可能性があります。感染によって獲得した免疫は時間とともに変化し、ウイルス側にも免疫を回避する変異が蓄積するためです。

2026年11月現在、世界保健機関(WHO)はNB.1.8.1の派生系統であるPQ.16.1.1などを監視対象に指定しています。国内でも国立健康危機管理研究機構の感染症情報提供サイトなどを通じてゲノムサーベイランスの結果が公開されており、変異株の置き換わりが継続的に観察されています。重要なのは、同じ株への再感染と、PCR検査で陽性が続く現象、いったん改善した症状が戻る再燃を区別することです。

【結論】新型コロナは前回と同じ株でも再感染するのか

コロナ同じ株再感染

新型コロナは、前回と同じ変異株による再感染が起こり得ます。これは単なる理論上の可能性ではありません。米国疾病予防管理センター(CDC)は、過去の臨床上の考慮事項において、初回感染と同じウイルス変異株による再感染も、異なる変異株による再感染も報告されていると説明しています。

ただし、「同じ株」という表現には注意が必要です。ウイルスの分類には複数の階層があり、日常会話で同じ株と呼んでいるものが、遺伝子的にも完全に同一とは限りません。

同じ株・同じ系統・同じゲノムは意味が違う

新型コロナウイルスの分類では、WHOが使用する変異株の呼称、PANGO系統による分類、個々のウイルスゲノムの塩基配列という異なるレベルがあります。

  • 同じ変異株:WHOなどが分類する大きなグループが同じであること。
  • 同じPANGO系統:ウイルスの進化的な系統分類が同じであること。
  • 同じゲノム:検体から解析した遺伝情報がほぼ同一であること。

例えば、同じオミクロン系統に属していても、下位の亜系統が異なる場合があります。また、同じPANGO系統に分類されても、その内部で細かな遺伝子変異が生じることがあります。

したがって、前回と同じオミクロン系統だったというだけでは、2回の感染でウイルスが完全に同一だったとは判断できません。

同じ系統による再感染を示した研究もある

同じ系統に属するウイルスによる再感染を検討した研究として、2021年に医学誌で報告されたエクアドルの症例があります。

この研究では、28歳男性が2回の感染を経験し、初回と2回目のウイルスがいずれもNextstrainの20Bクレード、PANGOのB.1.1系統に分類されました。全ゲノム解析による比較では、単純なウイルス残存や再活性化だけでは説明しにくい遺伝的変化が確認され、同じクレード内での再感染を支持する結果となりました。

一方、スペインで行われた2022年の研究では、再陽性となった症例の中に、同じウイルス株が関係する再燃と考えられるケースも確認されています。こうした症例には免疫抑制状態の患者が含まれており、再感染と持続感染を区別する難しさも示しています。

ここから分かるのは、同じ系統での再感染は否定できないものの、同じ系統の再陽性がすべて新しい感染を意味するわけではないということです。

再感染までの期間に絶対的な基準はない

CDCは、前回の感染から数週間という短い期間で再感染する可能性もあると説明しています。ただし、短期間の再感染はまれです。

また、CDCの研究では、初回の陽性検体採取から90日を超えた再陽性、またはゲノム解析によって異なる系統が確認されたケースなどが再感染の判定に用いられています。

この90日という期間は、感染の生物学的な限界を示す数字ではありません。90日以内にも再感染は起こり得ますが、前回の感染で残ったウイルスRNAが検出されている可能性があるため、慎重な判断が必要になるという意味です。

【原因を解説】コロナはなぜ同じ株でも再感染するのか

同じ変異株に再び感染する理由は、感染後に得られる免疫が永久に続くわけではなく、ウイルス側も免疫から逃れる性質を獲得するためです。

加えて、感染した人の年齢、健康状態、免疫抑制の有無、ワクチン接種歴、曝露したウイルス量なども再感染の可能性に関係します。

1.感染後の抗体価は時間とともに低下する

新型コロナに感染すると、体内ではウイルスに対抗する抗体が作られます。特にウイルス表面のスパイクタンパク質を標的とする中和抗体は、ウイルスが細胞に侵入するのを妨げる役割を持っています。

しかし、感染直後に高まった抗体価は、その後徐々に低下します。感染から数か月が経過すると、感染そのものを防ぐ力が弱くなる場合があります。

2025年10月にnpj Virusesで公表された抗体の持続性に関する研究では、mRNAワクチン接種後の抗体減衰を分析し、追加接種や感染歴を伴うハイブリッド免疫では抗体の持続性が異なることが示されました。

同研究のモデルでは、抗体の半減期は2回接種のみの場合で約59.8日、追加接種後で約99.7日、ハイブリッド免疫の場合で約241日と推定されています。

ただし、これらは特定の研究条件における抗体量の推定値です。実際に再感染を防げる期間を、そのまま日数に置き換えることはできません。

2.免疫逃避を起こす変異が生まれる

新型コロナウイルスはRNAウイルスであり、増殖を繰り返す過程で遺伝子変異が生じます。

特に注目されるのが、スパイクタンパク質の変異です。スパイクタンパク質はウイルスが人間の細胞に侵入する際に関係する構造であり、免疫が認識する重要な標的でもあります。

この部分に変化が起こると、過去の感染やワクチン接種によって作られた抗体が、以前ほど効率的にウイルスを認識できなくなる場合があります。これが免疫逃避と呼ばれる現象です。

免疫逃避は、過去に感染した変異株と大きく異なる新しい系統だけに起こるわけではありません。同じ大きな系統に属するウイルスでも、時間の経過とともに変異が蓄積すれば、既存の免疫による防御が弱まる可能性があります。

3.免疫記憶があっても感染を完全には防げない

免疫には、抗体だけでなく、B細胞やT細胞による免疫記憶もあります。

B細胞は再びウイルスに遭遇した際に抗体を作る働きを担い、T細胞は感染した細胞への免疫応答などに関係します。

これらの免疫記憶は、再感染した場合にも重症化を抑えるうえで重要です。ただし、ウイルスが鼻や喉の粘膜に侵入した段階で、必ず感染を阻止できるわけではありません。

つまり、感染を防ぐ免疫と、感染後の重症化を防ぐ免疫は同じものではありません。再感染しても軽症で済むケースがある一方、免疫機能が低下している人などでは重い症状が出る可能性があります。

4.免疫状態や曝露環境にも個人差がある

同じ時期に同じ変異株へ曝露しても、全員が感染するわけではありません。

高齢者、免疫抑制治療を受けている人、基礎疾患のある人などは、感染後の免疫応答が十分に得られない場合があります。

また、換気の悪い室内で長時間過ごすことや、感染者との接触状況も感染リスクに影響します。前回感染したからといって、次の曝露で必ず防御できるわけではないのです。

【2026年最新】WHOのPQ.16.1.1と国内ゲノムサーベイランスの実態

2026年の変異株動向を理解するうえで重要なのが、WHOによる国際的な監視と、日本国内のゲノムサーベイランスです。

WHOは2026年7月27日、NB.1.8.1の子孫系統であるPQ.16.1.1を「監視下の変異株(VUM)」に指定しました。

WHOが監視するPQ.16.1.1とは何か

PQ.16.1.1は、NB.1.8.1から派生したSARS-CoV-2の系統です。WHOの評価資料では、スパイクタンパク質にD253G、N417T、D420N、I478Tという追加変異を持つ系統として説明されています。

これらの変異によって免疫逃避の性質が加わる可能性がありますが、WHOは2026年7月の評価時点で、実際のウイルスの性質を直接確認する表現型データが限られているとしています。

また、WHOによる世界全体の追加的な公衆衛生リスク評価は「低い」という判定でした。流行中の他の変異株と比べて、臨床的な重症度が高まったことを示す監視データも確認されていません。

つまり、免疫逃避の可能性があることと、重症化リスクが高いことは別の問題です。

NB.1.8.1も免疫逃避が評価された系統

NB.1.8.1はJN.1から派生した系統で、WHOは2025年5月23日に監視下の変異株として評価しました。

WHOの評価では、NB.1.8.1は他の流行系統と比べて増加する傾向を示したものの、LP.8.1に対する追加的な免疫逃避は限定的とされました。また、重症度が他の流行系統より高いことを示す証拠も確認されていません。

2026年7月に評価されたPQ.16.1.1は、このNB.1.8.1の子孫系統に当たります。変異株の名前が変わるたびに危険性が大幅に増すわけではなく、感染性、免疫逃避、重症度を分けて評価する必要があります。

2026年10月公表の国内ゲノムサーベイランス

国内の変異株動向については、国立健康危機管理研究機構の感染症情報提供サイトで、国立感染症研究所が集計した全国のゲノムサーベイランス結果が公開されています。

2026年10月21日時点の資料では、2026年9月に地方衛生研究所で解析された検体について、PANGO系統別の検出状況が公表されています。

同資料に記載された9月の解析対象は145検体で、主な内訳は次のとおりです。

系統・分類 検体数 検出割合 位置付け
BA.3.2系統 72 49.66% 国内解析の最多系統
NB.1.8.1系統 42 28.97% 免疫逃避が評価された系統
XFG系統 7 4.83% WHOの監視対象系統
その他 24 16.55% 複数の系統など
合計 145 100.00% 2026年9月の解析対象

この数字から読み取れるのは、国内の解析検体ではBA.3.2系統とNB.1.8.1系統が大きな割合を占めていたことです。

ただし、145検体は日本国内で発生した全感染者数ではありません。急性呼吸器感染症(ARI)サーベイランスの一環として解析された検体の集計であり、検査対象や検体数によって割合は変わります。感染者全体の49.66%がBA.3.2に感染していたと解釈することはできません。

国立感染症研究所の資料では、2026年9月時点で、いずれの系統にも大きな変化は見られないと整理されています。

WHOの世界データと日本のデータは分けて読む

WHOの2026年10月4日終了週の世界集計では、提出されたゲノム配列に占める割合はXFGが約52.2%、JN.1が約22.2%、NB.1.8.1が約7.34%でした。

国内の2026年9月の解析結果とは、優勢な系統の構成が異なっています。これは集計期間、地域、解析対象、検体数などが異なるためです。

また、WHOはXFG、NB.1.8.1、PQ.16.1.1、BA.3.2について、当時の利用可能な証拠では、他の流行系統と比較して追加的な公衆衛生リスクを示していないと評価しています。

こうしたデータから分かるのは、2026年もウイルスの系統交代と細かな変異が続いている一方、変異株の名称や検出割合だけで個人の再感染リスクや重症化リスクを決めることはできないという点です。

【検査で見分ける】再感染と再燃の違い、PCR陽性が続く原因

新型コロナの再感染を考える際に、特に注意したいのが「再感染」「再燃」「再陽性」の違いです。

一度症状が改善した後に再び発熱や咳が出たり、PCR検査で再び陽性になったりしても、それだけでは新しい感染が起きたとは断定できません。

再感染とは新しい感染エピソードが起きること

再感染とは、前回の感染から回復した後、再びSARS-CoV-2に感染することです。

新しい感染者との接触や、流行している変異株への曝露などがきっかけになります。前回と異なる変異株だけでなく、同じ変異株に属するウイルスによる再感染も考えられます。

再燃・リバウンドとは何が違うのか

再燃は、前回の感染による症状やウイルスの検出が再び目立つ状態を指す文脈で使われます。

一方、CDCが説明するCOVID-19リバウンドは、症状が改善した後、または検査で陰性になった後に、症状が戻ったり再び陽性になったりする現象です。

CDCによれば、リバウンドは初回の症状が改善してから3~7日後に起こることがあり、抗ウイルス薬を使用した人だけでなく、使用していない人にも報告されています。

リバウンドは通常、軽い症状で数日以内に改善する傾向があります。ただし、感染性が残っている可能性があるため、周囲への感染を防ぐ対応が必要です。

再感染と再燃を区別するには、症状が改善した期間、再び症状が出た時期、感染者との接触歴、検査結果、必要に応じてゲノム解析などを総合的に検討します。

PCR検査で陽性が続く原因

PCR検査はウイルスの遺伝子を検出する検査です。抗原検査よりも少ない量のウイルスRNAを検出できるため、感染後に症状が改善しても陽性が続くことがあります。

その理由の一つが、体内に残ったウイルスのRNA断片です。PCR検査はウイルスそのものが現在も活発に増殖しているかどうかを直接判定する検査ではありません。

CDCも、NAAT検査を含む検査では、感染後に最大90日程度陽性が続く場合があると説明しています。

したがって、PCR陽性が続いているからといって、必ずしも感染力のあるウイルスが残っているとは限りません。

ただし、免疫機能が大きく低下している人では、ウイルスの排出や感染が長期間続くケースもあります。こうした場合は、一般的な感染後のPCR陽性とは異なる医学的評価が必要です。

再感染と再燃の比較
  • 再感染:回復後に新たな感染が成立する。新しい曝露や異なるゲノム情報などが判断材料になる。
  • 再燃:前回の感染が十分に終息しておらず、症状やウイルス検出が再び目立つ状態。
  • リバウンド:症状改善や陰性化の後に症状または陽性反応が戻る現象。
  • RNA残存:感染後に残った遺伝子断片がPCRで検出される状態。

特に前回の感染から90日以内に再び陽性となった場合は、検査結果だけで再感染と決めつけないことが大切です。

【抗原検査・PCR・ゲノム解析】同じ株かどうかは確認できる?

再感染が疑われた場合、どの検査を受ければよいのでしょうか。重要なのは、それぞれの検査が何を調べるためのものなのかを理解することです。

抗原検査は現在の感染を調べるための検査

市販の新型コロナ抗原検査キットは、ウイルスのタンパク質を検出します。一般的に短時間で結果が分かり、現在の感染を調べる際に役立ちます。

新しい症状が出て、前回の感染後に十分な回復期間があった場合、抗原検査で陽性となれば新たな感染を疑う材料になります。

ただし、抗原検査で陽性になっても、前回と同じ変異株なのか、新しい系統なのかまでは分かりません。

また、抗原検査はPCRより検出感度が低く、感染初期や無症状の場合には陰性になることがあります。1回の陰性結果だけで感染を否定することはできません。

PCR検査はウイルスRNAを高感度で検出する

PCR検査はウイルスRNAを増幅して検出するため、感染の診断に役立ちます。

一方、前回の感染から間もない時期には、RNAの残存によって陽性になる可能性があります。

CDCの検査案内では、感染後90日以内の再感染判断が難しいことを踏まえ、状況に応じた抗原検査の利用が案内されています。

前回の感染からの日数、症状の変化、接触歴などを医療機関に伝え、適切な検査を選ぶことが重要です。

ゲノム解析ならウイルスの系統を比較できる

前回と今回のウイルスが同じ系統なのか、それとも異なる系統なのかを詳しく調べるには、ゲノム解析が必要です。

ゲノム解析では、ウイルスの遺伝情報を読み取り、PANGO系統などの分類を行います。2回の感染時に採取された検体を比較すれば、遺伝的な違いを調べることができます。

例えば、初回がNB.1.8.1系統で、2回目がXFG系統と判定された場合は、異なる系統による感染を示す有力な証拠になります。

一方、両方がNB.1.8.1系統と判定された場合でも、完全に同じウイルスとは限りません。系統の内部にある細かな遺伝的差異を比較する必要があります。

また、ゲノム解析は一般的な市販の抗原検査とは異なり、すべての患者に対して日常的に実施される検査ではありません。公衆衛生上の監視や研究、必要な症例の詳しい評価などで利用されます。

検査ごとに分かること・分からないこと
  • 抗原検査:ウイルスのタンパク質を検出する。新しい感染を疑う際に役立つが、系統の特定はできない。
  • PCR検査:ウイルスRNAを検出する。高感度だが、感染後のRNA残存による陽性との区別が必要。
  • ゲノム解析:ウイルスの遺伝情報を調べる。同じ系統か、異なる系統かを比較するための重要な方法。
  • 抗体検査:過去の感染やワクチン接種によって生じた抗体を調べる。現在の感染診断には使用しない。

FDAも、抗体検査は現在の感染を診断する目的や、感染を防ぐ免疫があるかどうかを判断する目的には使用できないと説明しています。

【感染後の免疫と予防】ハイブリッド免疫があっても再感染する理由

新型コロナの再感染を防ぐうえでは、感染歴だけでなく、ワクチン接種によって得られる免疫も重要です。

感染とワクチン接種の両方によって獲得される免疫は、ハイブリッド免疫と呼ばれています。

ハイブリッド免疫は感染歴だけの免疫より強いのか

複数の研究では、感染とワクチン接種の両方を経験した人は、感染のみ、あるいはワクチン接種のみの人と比較して、より強く持続的な免疫応答を示す傾向が報告されています。

2023年に医学誌Lancet Infectious Diseasesで公表された系統的レビューとメタ解析では、ハイブリッド免疫による防御効果が、感染予防と重症化予防の両面で評価されました。

同研究では、感染予防効果は時間の経過とともに低下する一方、入院や重症化に対する防御効果は比較的高く維持される傾向が示されています。

つまり、ハイブリッド免疫は再感染を完全に防ぐものではありませんが、感染した場合の重症化リスクを抑えるうえで重要な役割を果たします。

抗体価が高ければ再感染しないのか

抗体価は免疫状態を考えるための指標の一つですが、数値だけで再感染の可能性を判断することはできません。

抗体検査には複数の種類があり、測定する抗体や検査方法によって結果が異なります。加えて、血液中の抗体量だけでは、粘膜免疫やT細胞などを含む免疫全体を評価できません。

FDAは、抗体検査の陽性結果が感染を防ぐ免疫を保証するものではないと説明しています。抗体検査の数値だけを根拠に、ワクチン接種や追加接種の必要性を判断することも推奨していません。

特に、過去の変異株に対して高い中和抗体が確認されても、新しい変異株に対して同じ防御効果が得られるとは限りません。

再感染を防ぐために実践したいこと

一度感染した経験があっても、基本的な感染対策を続けることが大切です。

  • ワクチン接種:年齢や健康状態に応じて、国内の最新の接種方針を確認する。
  • 換気:室内の空気を入れ替え、換気の悪い環境で長時間過ごすことを避ける。
  • マスク:流行時や医療機関、高齢者と接する場面などでは適切に活用する。
  • 体調管理:発熱や喉の痛み、咳などが出た場合は無理に外出しない。
  • 早期受診:高齢者や基礎疾患のある人、免疫機能が低下している人は、症状が軽くても早めに医療機関へ相談する。

CDCは、重症化リスクが高い人に対し、感染が疑われる場合には早期の検査や治療相談を推奨しています。抗ウイルス薬には使用開始時期の条件があるため、症状が出てから時間を空けすぎないことも重要です。

感染後に特に注意したい症状

再感染した場合も、初回感染と同じように症状を観察する必要があります。

発熱や咳、喉の痛み、倦怠感などが再び現れた場合は、無理をせず休養を取りましょう。

息苦しさ、胸の痛み、意識状態の変化、急激な体調悪化などがある場合は、速やかに医療機関へ相談してください。

また、感染後に倦怠感や息切れ、集中力の低下などが長引く場合は、単純な再感染と決めつけず、感染後症状についても医師に相談することが大切です。

【プロの結論】同じ株への再感染で本当に注目すべきポイント

新型コロナの再感染を考えるうえで、最も重要なのは、過去に感染した変異株の名前だけで今後の感染リスクを判断しないことです。

2026年のWHOによるPQ.16.1.1の評価や、国内のゲノムサーベイランスは、ウイルスが現在も進化していることを示しています。しかし、免疫逃避を示唆する遺伝子変異があることと、重症化しやすいことは同義ではありません。

また、同じ株による再感染が疑われる場合も、検査結果の読み方が重要です。PCR陽性が続いているだけでは、新しい感染が起きたとは判断できません。

判断する際には、次の3点を押さえておくとよいでしょう。

  • 時間経過:前回の感染からどの程度経過し、どれくらい症状が改善していたか。
  • 検査結果:抗原検査やPCR検査の結果がどう変化しているか。
  • ウイルスの系統:必要に応じてゲノム解析によって初回と今回のウイルスを比較できるか。

特に高齢者や免疫機能が低下している人では、同じ株かどうかの判定に時間をかけるより、症状の変化を早期に医療機関へ伝え、適切な診断と治療につなげることが優先されます。

【コロナの同じ株による再感染】に関するよくある質問(FAQ)

Q1:新型コロナは前回とまったく同じ株に再感染しますか?
A1:はい、可能性があります。CDCは同じ変異株による再感染も報告されていると説明しています。ただし、同じ変異株の分類に属することと、ウイルスの遺伝情報が完全に同一であることは別です。

Q2:新型コロナは感染から1か月以内でも再感染しますか?
A2:可能性はあります。CDCは数週間後の再感染も起こり得るとしています。ただし、感染直後のPCR陽性は前回の感染によるRNA残存やリバウンドの可能性もあるため、検査結果だけでは判断できません。

Q3:PCR検査が陽性なら、まだ感染力がありますか?
A3:必ずしもそうではありません。PCRはウイルスRNAを検出するため、感染後に残ったRNA断片でも陽性になる場合があります。陽性結果だけで感染力の有無を判断することはできません。

Q4:抗原検査で前回と同じ株かどうか分かりますか?
A4:分かりません。抗原検査はウイルスのタンパク質を検出する検査です。同じ株か異なる株かを判定するには、ゲノム解析による遺伝情報の比較が必要です。

Q5:一度感染すれば、次の感染では軽症になりますか?
A5:必ず軽症になるわけではありません。感染やワクチン接種による免疫は重症化リスクを下げる可能性がありますが、年齢、基礎疾患、免疫状態、変異株などによって症状は異なります。

Q6:2026年のPQ.16.1.1は危険な変異株ですか?
A6:WHOは2026年7月27日の評価でPQ.16.1.1を監視下の変異株に指定しましたが、世界全体での追加的な公衆衛生リスクは低いと評価しています。免疫逃避の可能性は指摘されているものの、重症度の増加を示す証拠は確認されていません。

Q7:抗体価を調べれば、再感染しない期間が分かりますか?
A7:分かりません。抗体価は免疫応答の一部を示す指標ですが、再感染を防げる期間を個人ごとに確定することはできません。抗体検査の数値だけで感染予防効果やワクチン接種の必要性を判断することは避けましょう。

新型コロナは、前回と同じ変異株でも再感染する可能性があります。感染によって獲得した抗体は時間とともに低下し、ウイルス側にも免疫逃避につながる変異が生じるためです。

2026年には、WHOがPQ.16.1.1を監視下の変異株に指定し、日本国内でもBA.3.2やNB.1.8.1などの系統がゲノムサーベイランスによって追跡されています。ただし、変異株の監視対象への指定は、直ちに重症化リスクの増加を意味するものではありません。

また、再感染と再燃、PCR陽性の持続は区別する必要があります。抗原検査やPCR検査で感染の状況を調べ、必要に応じてゲノム解析を行うことで、より詳しい判断が可能になります。

感染歴やハイブリッド免疫があっても、再感染の可能性は残ります。大切なのは、過去の感染を過信せず、体調の変化に注意しながら、ワクチン接種、換気、適切なマスク使用、早期受診などを組み合わせることです。

今後もWHOの変異株評価と国内ゲノムサーベイランスを継続的に確認することで、新しい系統の広がりや免疫逃避の動向を把握しやすくなります。

主な根拠資料(2026年11月時点)

- WHO「PQ.16.1.1 初期リスク評価」(2026年7月27日)
- WHO「COVID-19変異株監視データ」(2026年10月4日終了週)
- 国立健康危機管理研究機構・感染症情報提供サイト「SARS-CoV-2変異株について」(2026年10月21日更新資料)
- CDC「About Reinfection」「Testing for COVID-19」
- CDC「Using SARS-CoV-2 Sequencing Data to Identify Reinfection Cases」(2024年)
- FDA「Antibody Testing for COVID-19」
- npj Viruses(2025年10月)抗体持続性に関する研究
- The Lancet Infectious Diseases(2023年)ハイブリッド免疫に関する系統的レビュー

編集上の重要な注意点: 国内の145検体の数値はゲノム解析された検体の構成比であり、全国の感染者に占める感染割合ではありません。また、WHOのVUM指定は監視上の分類であって、危険度の認定そのものではありません。

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篠原 淳平

アニメとゲームの新作情報を担当。制作会社・配信元の公式告知と登壇情報を照合して記事化します。

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